Kubo Không Để Tôi Vô Hình xoay quanh cuộc sống của học sinh trung học Junta Shiraishi, người luôn khao khát có một tuổi trẻ trọn vẹn dù sự vắng mặt thường xuyên khiến chỗ ngồi của anh trong lớp dường như luôn trống. Bí ẩn hơn, tin đồn lan truyền rằng ai nhìn thấy Shiraishi sẽ nhận được phước lành đặc biệt. Nagisa Kubo, cô bạn cùng bàn duy nhất nhận ra sự hiện diện của anh, thường xuyên tạo nên những tình huống hài hước và đáng yêu xung quanh Shiraishi. Qua những trò đùa này, nhân vật chính dần khám phá ra rằng tuổi trẻ không hề nhàm chán như anh từng nghĩ. Dàn diễn viên nổi tiếng như Kana Hanazawa và Kengo Kawanishi cùng đạo diễn tài năng Đang cập nhật đã mang đến một câu chuyện đầy cảm xúc và thú vị về tuổi học trò khó quên.